急!!!!~~股份有限公司負責人薪資扣繳~~ - 法律

我們公司是股份有限公司，但是員工只有四人，
股東是老闆的爸爸。
往年是請事務所作帳和報稅的，
但今年老闆收回帳務要我處理...
我慢慢學習理論上是會了...
但是負責人的薪資卻不知道該怎麼申報?
我買的稅務或會計書上沒有這部分，
上網查和問會計師也有不同的答案...
網路上是說可申報也可不申報，
申報的話要照實申報，
問會計師(不是原本那家)則是說可以只報一萬，
而我們公司原本委託的那家去年的負責人薪資扣繳金額也並非以一萬計算
(我還不知道那數字怎麼來的~下週一會再打電話問看看~不過我怕他們不理我~
之前打去態度就很不好了~)
請問：
1.股份有限公司負責人的薪資申報有相關法規規定嗎?
2.若可申報也可不申報，那是自己可以選擇報或不報嗎？
要先向甚麼政府單位申請或報備過嗎?
3.申報與不申報又有甚麼差別呢?
4.會計師說可以只報一萬，那是合法的嗎？(若不合法請幫我附法規)
5.我老闆說負責人薪資報多少沒差，因為營利所得和個人綜所都是他名下所有，
我不知道這樣的觀念對嗎(因為老闆自己也沒實際申報過)
6.老闆有自願提繳每月1998元退休金，勞健保我不知道，
那這樣要怎麼辦理薪資扣繳呢?
我不想做違法的事，但沒釐清事實前也不知該怎麼做....
現在工作很不好找，希望高手可以相救~拜託拜託~~~!!!

Update:
辰俞大大您好：
又麻煩您了~謝謝~!!
1.請問我們老闆是自願提繳勞退金1998(不是勞保費唷~
薪資結算是我老闆在處理的~所以我不知道是否有勞健保支出部分)，
如果是提繳退休金也是依照這個公式嗎？
1,998/6%=33,300
2.負責人薪資扣繳申報是否有相關規定呢？
(例如：若負責人未支領薪資、可不用申報的；老闆有要自願提繳勞保的6%、表示有加保在公司、投保薪資為1,998/6%=33,300。若扣繳憑單上有自提金額的話、那必須按投保金額33,300*12=399,600申報扣繳憑單。
是否有法條可以讓我參考呢？)
感謝您！
Update 2:
辰俞大大感謝您的補充~再請問一下~
1.依您所言，若負責人有自願提繳勞、健保、退休金的話，
依公式推算的投保薪資不就有三種版本，
這樣要依哪種投保薪資申報呢？
2.若負責人無自願提繳，可以用實際支領金額申報。
那會計師為何會跟我說：
老闆有可能因為營運狀態不佳沒有實際支領薪水，
所以可以報一萬就好....?
而且不止一家會計事務所這樣回答，
難道身為合法執業的會計他們不懂合法與否嗎?
Update 3:
抱歉我發現我問太多了~
為表誠意，我另開一個問題~
麻煩大大再幫我解答~謝謝!!
問題連結：
http://tw.knowledge.yahoo.com/question/question?qi...