離職後特休換薪水的疑問 - 法律

我要離職了,目前還剩下9天的特休
按照勞動基準法老闆必須要付給我9天特休的工資
但老闆的算法是以我的本薪算
我的薪資結構是
本薪12700
職務津貼12000
交通津貼4000
全勤獎金2000
季獎金和業績獎金-不固定
這樣我的全薪大約是3萬3左右
去年(98)年終剩下的特休轉換成工資的算法是本薪加職務津貼
可是離職時所剩的特休老闆卻是用本薪來算
我想問老闆這樣的算法合法嗎??
若不合法,有什麼法規可以佐證呢??
補充：
我打電話去勞基法權益維護促進會詢問過了
他的回答是
依照勞動基準法實行細則第24條第3項規定：
特別休假因年度終結或終止契約而會休者，其應休未休之日數，雇主應發給工資
而工資的定義可以參照
行政院勞工委員會85年2月10日台85勞動二字第103252號函指出：勞動基準法第二條第三款規定「工資：謂勞工因工作而獲得之報酬；包括工資、薪金及按計時、計日、計月、計件以現金或實物等方式給付之獎金、津貼及其他任何名義之經常性給與均屬之」，勞委會87年8月20日87台勞動二字第035198號函進一步指出「績效獎金如係以勞工工作達成預定目標而發放，具有因工作而獲得之報酬之性質，依勞動基準法第二條第三款暨施行細則第十條規定，應屬工資範疇」。
如果我把法條給老闆看，他還是執意要以本薪換算的話
倒底老闆有沒有違法？？如果我去申訴的話成功的機率大不大呢？？
因為勞基法權益維護促進會只跟我說可以去勞工局申訴
然後勞資雙方協商
讓我有點疑惑，如果是老闆違法的話為什麼還需要協商呢？？
他應該要把我應得的給我不是嗎？？
麻煩有經驗的人或是法律達人幫我回答一下
感恩感恩！！