請問已婚者服研發替代役的繳稅疑問 - 法律

我和老公今年年底左右新婚，戶籍同在台北
老公目前在科技公司服研發替代役(需三年)
我們的情況是
1.今年新婚，老公正式工作從明年開始
2.研發替代役只算底薪x12個月約為90萬，但每月只會領內政部給服研替役的錢(我忘了好像是一個月兩萬?)，其餘差額公司會補足，補足名目好像是到職獎金
3.我沒有在公司工作了，但有加入地方工會保勞健保，用最低的保，每年年薪算起來是23萬左右
4.除了底薪差額由公司補足，一般科技業好像是月薪x14個月，還有加班費(我知道每月46小時內不須繳稅)，以及一年兩次的獎金
5.每年有租屋費月大約13萬以上(租屋減稅好像最高到12萬)
6.看病和保險皆可扣除稅額，請問上限是多少呢?
請問是應該分開申報比較好嗎?或者我夠低不用申報呢?
也請問我老公如果獨自申報，要怎樣可以降到下一個級距呢?�